化疗是使用药物来杀死癌细胞或者阻止癌细胞的分裂从而来抑制癌细胞生长的方法。因为血细胞和头发细胞等正常细胞也会受到影响，所以化疗会带来副作用。化疗的药物可通过口服、静脉或肌肉注射，这些药物进入血液，通过血液流动对全身的癌细胞产生作用。这种方法称为全身化疗。如果化疗的药物是直接注入脊椎内，或是胸、腹腔内的话，药物只会对这些区域内的癌细胞产生作用。这就是局部化疗。

局部化疗通常被用于肝癌的治疗。化疗中，一个带抗癌药物的小泵被植入人体，这个小泵就会把药物直接投入通往肿瘤的血管中。另一种局部化疗方法是肝动脉的药物栓塞。这种方法是先堵塞肝动脉（给肝供血的主要血动脉），接着把抗癌药物注入肝脏和栓塞之间。然后肝的血管就会把药物运送到肝的每个地方。只有一小部分药物会泄漏影响到身体的其它部位。栓塞可以是暂时的也可以是永久的，这主要取决于用来栓塞的物质。

肿瘤内无水酒精注射：由超声波引导的细针把乙醇（酒精）直接注射进肿瘤内来杀死癌细胞。这种治疗一周可以注射一到两次。通常只需局部麻醉，但是如果病人肝脏上有很多肿瘤的话就需进行全身麻醉。