原发性肝癌有多种不同的治疗方法。有些方法是标准方法（目前广泛接受并使用的），而有些方法则还在临床试验中。开始治疗以前，患者不妨考虑一下临床实验疗法。临床试验疗法目的在于改进现有标准的治疗方法从而给癌症患者带来新的治疗方案。如果临床试验疗法其疗效比现有的治疗方法更为有效，那这种新的方法就可能变成标准治疗方法。

外科手术：

治疗原发性肝癌有如下几种外科手术方法：

冷冻治疗：这种方法是用一种器械来冷冻并毁灭异常组织，如原位癌（一种很早期、不扩散到周围组织的癌）。医生手术时可以用超声波来引导手术器械。

部分肝切除：把含有肿瘤的部分肝脏切除。被切除的部分可能是一块组织，整个肝叶，也可能是连着健康组织把一大块肝脏全部切除。剩下的肝组织承担起肝的全部功能。

全肝切除和肝脏移植手术：切除整个肝脏并植入别人捐赠的肝。只有当癌细胞只局限于肝脏并且有捐赠的肝的情况下才能实施肝脏移植手术。病人在等待捐赠肝脏的时候，最好采用其它护肝治疗方法。

高频部分切除手术：用专用探针直接插入肿瘤，将高频波导入肿瘤，以消灭癌细胞。